במדבר יהודה מצויות מערות טבעיות רבות, והגישה אל חלקן קשָ ה. כך יכלו תושביו הקדוּמים של מדבר יהודה למצוא בו מגורים ומסתור. בתמונה: מערות קוּמראן שבמורדות מדבר יהודה. במערות נתגלו מגילות עתיקות, הכּתוּבוֹת בכתב עברי קדוּם והן בעלות חשיבות היסטורית ודתית רבה. המגילות נשמרו היטב בזכות האקלים המדברי היבש.