המכון הגדול ביותר בישראל לטיפול בשפכים הוא השפד‭– ן"‬ המכון לטיהור שפכי גוש דן. השפד"ן, שבנייתו בחולות ראשון לציון החלה בשנת ‭,1969‬ אוסף ומטפל בשפכים של כל אזור גוש דן - שטח עירוני גדול מאוד, הכולל גם מפעלי תעשייה. הטיפול בשפכים נעשה בכמה שלבים בתוך בּרכוֹת ענק. בסוף התהליך המים מוזרמים אל החולות ומחלחלים לתוכם, וחלחולם הוא שלב הסינון האחרון. משם, מעומק החולות, המים נשאבים והם מועברים לשימושים השונים.